索非亞醫科大學是保加利亞一所歷史較為悠久的高等醫學教育機構。索非亞醫科大學建於1950年，其前身是索菲亞大學醫學院。1954年索菲亞大學醫學院組建成為索菲亞高等醫學研究所，1995年該研究所正式命名為索菲亞醫科大學。索菲亞醫科大學現設有：醫學院、口腔醫學院、醫藥學院、公共衛生學院。同時還設有索非亞醫學院、弗拉察醫學院和布拉戈耶夫格勒醫學院。索菲亞醫科大學現開設有本科、碩士和博士專業：醫療、醫療康復及歐洲療法、牙科醫學、藥劑學、護理學、衛生保健、公共衛生及公共衛生管理、放射技術、康復助理、藥劑師、醫療衛生監督、按摩師、醫療化妝品認證等。在2009年保加利亞國家高等教育機構評定中，索非亞醫科大學排名第一，成為保加利亞的名牌大學。
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